Область научных интересов: Наша группа занимается исследованием
механизмов регуляции экспрессии генов нетранслируемых РНК, транскрибируемых
РНК-полимеразой III, в
пролиферирующих и апоптотических клетках эукариот. В нашей работе используется
целый ряд классических и самых современных методов молекулярной биологии:
изучение содержания разных типов РНК в клетке методом ОТ-ПЦР в реальном
времени, исследование транскрипционной активности генов методом
иммунопреципитации хроматина, а также выяснение роли метилирования ДНК в
экспрессии мобильных элементов (Alu-последовательностей)
генома человека.
Выполнение работ в данном
направлении исследований позволит студентам приобрести навыки в методах,
востребованных в лабораториях биохимической и молекулярно-биологической
направленности.
Основные публикации:
Обзорные статьи:
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Роль экспрессии мобильных элементов класса SINE и генов, транскрибируемых РНК-полимеразой III, в регуляции внутриклеточных процессов (обзор). // Молекулярная биология. 2008. Т. 42. № 4. С. 547-558. [Ссылка]
Nikitina T. V., Tischenko L. I. Role of Genetic Element SINE Expression in Apoptosis of the Cell. In: Corvin A.J., editor. New Developments in Cell Apoptosis Research. Hauppauge, NY: Nova Science Publishers, Inc.; 2007. P. 159-178. [Ссылка]
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Компьютерное предсказание потенциальных сайтов фосфорилирования белков и некоторые экспериментальные методы их исследования. // Вестн. С.-Петерб. ун-та. Сер. 3. 2006. Вып. 2. С. 42-50.
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Транскрипционная машина РНК-полимеразы III: строение и регуляция транскрипции (обзор). // Молекулярная биология. 2005. Т. 39. № 2. С. 179-192. [PubMed]
Статьи:
Никитина Т.В., Гао Л., Карпачева К.Е., Тищенко Л.И. Изменение экспресии генов тРНК и Alu-повторов молодых субсемейств Ya5 и Yb8, транскрибируемых РНК-полимеразой III, в клетках человека U937 при апоптозе, индуцированном камптотецином // Вестн. С.-Петерб. ун-та. Сер. 3. 2009. В печати.
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Компьютерный поиск потенциальных участков посттрансляционных модификаций субъединиц РНК-полимеразы III человека. // Молекулярная биология. 2005. Т. 39. № 3. С. 437-444. [PubMed]
Тищенко Л.И., Никитина Т.В., Седова В.М. Фосфорилирование РНК-полимеразы III ядерными протеинкиназами. // Биохимические и молекулярно-биологические основы физиологических функций. Сб. статей. СПб.: Изд-во С.-Петерб. Ун-та, 2004. С. 241-251.
Nikitina T. V., Nazarova N.Y., Aksenov N.D., Tishchenko L. I., Tuohimaa P., Sedova V. M.. Small stable RNA level depends on the physiological state of the cell. // Цитология. 2004. Т. 46 № 5. С. 437-441. [PubMed][файл DJVU]
Никитина Т. В., Назарова Н. Ю., Тищенко Л. И., Туохимаа П., Седова В. М. Использование метода RT-PCR в реальном времени для изучения уровня экспрессии малых стабильных РНК в клетках эпидермоидной карциномы человека А431. // Цитология. 2003. Т. 45. №4. С.392-402. [PubMed] [файл DJVU]
Никитина Т.В., Тищенко Л.И., Седова В.М. Фосфорилирование-дефосфорилирование холоэнзима РНК-полимеразы III - модификации, регулирующие уровень транскрипции in vitro. // Цитология. 2002. Т. 44. № 3. С. 277-284. [PubMed]
Никитина Т.В., Седова В.М., Тищенко Л.И. Влияние фосфорилирования РНК-полимеразы III плаценты человека на интенсивность транскрипции in vitro (предварительные результаты). // Вестник Санкт-Петербургского университета. Сер. 3. 1998. Вып. 4 (№24). С. 86-91.
Балашова М.В., Никитина Т.В., Тищенко Л.И., Седова В.М. РНК-полимераза I ядер плаценты человека. // Цитология. 1998. Т.40. №10. С. 943-947. [PubMed]
Учебно-методические пособия:
Тищенко Л.И., Романовская Е.В., Мандельштам М.Ю., Никитина Т.В. Биохимические и молекулярно-биологические методы анализа генома: Учебно-метод. пособие. - СПб., 2006.- 96 с. [PDF-файл доступен по запросу на e-mail]
Тищенко Л.И., Никитина Т.В. Методы амплификации нуклеиновых кислот: принципы и возможности: Учебно-метод. пособие. - СПб., 2008. - 92 с. [PDF-файл доступен по запросу на e-mail]
элементов (
