Монографии:
Кокряков В.Н. Очерки о врожденном иммунитете. "Наука",
СПб., 2006, 262с.
Кокряков В.Н. Биология антибиотиков животного происхождения. "Наука",
Спб., 1999, 162с.
Карасев В.А., Стефанов В.Е., Курганов Б.И.,
Надмолекулярные биоструктуры: организация,
функционирование, происхождение. Итоги науки и техники. Т.31.
Москва 1989, 200 с.
Избранные научные публикации (1999–2008 гг.):
Shamova, O., Orlov, D., Stegemann, C., Czihal, P., Hoffmann, R., Brogden, K., Kolodkin, N., Sakuta, G., Tossi, A., Sahl, H.-G., Kokryakov, V. & Lehrer,
R. (2008) ChBac3.4: A novel proline-rich
antimicrobial peptide from goat leukocytes.
Int. J. Pept. Res. Ther. В печати
Stegemann, C., Kolobov, A. Jr., Leonova, Y.F., Knappe, D., Shamova, O., Ovchinnikova, T.V., Kokryakov, V.N. & Hoffmann, R. (2008) Isolation, purification and de novo sequencing of TBD-1, the first beta-defensin from leukocytes of reptiles.
Proteomics. В печати.
Fu, Z., Voynova,
NE, Herdendorf, TJ, Miziorko, HM and Kim J-J P (2008)
Biochemical and structural basis for feedback inhibition of mevalonate kinase
and isoprenoid metabolism. Biochemistry, V 47, P 3715-3724
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Роль экспрессии мобильных элементов класса SINE и генов, транскрибируемых РНК-полимеразой
III, в регуляции внутриклеточных процессов (обзор). // Молекулярная
биология. 2008. Т. 42. № 4. С. 547-558.
Чихиржина Г. И., Аль-Шехадат
Р. И., Чихиржина Е. В. (2008) Транскрипционные факторы семейства
NF1. Роль в ремоделировании хроматина. Молекулярная биология . №3.
Tulub A
A. and Stefanov V. E. New horizons of adenosinetriphosphate energetics arising
from interaction with magnesium cofactor.
// European Biophysics Journal. V. 37. 2008
Berlov M.N.,
Korableva E.S., Andreeva Y.V., Ovchinnikova T.V., Kokryakov V.N. Lactoferrin
from canine neutrophils: isolation and physicochemical and antimicrobial
properties. // Biochemistry (Mosc). 2007. Vol. 72, No 4. P.
445-451.
Ovchinnikova T.V.,
Shenkarev Z.O., Nadezhdin K.D., Balandin S.V., Zhmak M.N., Kudelina I.A.,
Finkina E.I., Kokryakov V.N., Arseniev A.S. Recombinant expression,
synthesis, purification, and solution structure of arenicin. // Biochem
Biophys Res Commun. 2007. Vol. 360, No 1. P. 156-162.
Стефанов В.Е.,
Тулуб А.А. Ион-радикальный механизм распада нуклеозидтрифосфата
до нуклеозидмонофосфата под Воздействием
катиона Mg2+ и радикальная природа синтеза одиночной цепи ДНК. Докл. РАН (2007), Т. 414, № 2, с. 1-3
Tulub A A. and Stefanov
V. E. Triplet-Singlet Spin Communication between DNA Nucleotides
serves the basis for Quantum Computing. Chem. Phys. Lett.
436. P. 258-262 (2007)
Nikitina T. V.,
Tischenko L. I. Role of Genetic Element SINE Expression in Apoptosis of the Cell
(Review). In: Corvin A.J., editor. New Developments in Cell Apoptosis
Research. Hauppauge, NY: Nova Science Publishers, Inc.;
2007; P. 159-178.
Myulberg A.A.,
Grishina T.V., Senik O.V. Characteristics of nuclear proteins from cells of rat
brain and spleen which regulate interleukin-2 gene expression. // Neurochemical
Journal. 2007. V. 1. P. 53-65.
Шавва А. Г., Морозкина С. Н.,
Ищенко И. В., Елисеев И. И., Селиванов С. И., Абусалимов
Ш. Н., Селиванов С. С., Каменева И. Ю., Ещенко
Н. Д. Синтез и биологические свойства 6-окса-D-гомо-8α-аналогов стероидных
эстрогенов. // Биоорг. химия. 2007, 33(3): 310-314.
Tsvetkova E. V., Aleshina G. M.,
Shamova O. V., Leonova L. E., Lehrer R. I., Kokryakov V. N. ?-Defensins
from blood leukocytes of the monkey Papio hamadryas. // Biochemistry
(Moscow), 2006, Vol. 71, No. 8, pp. 879-883.
Назарова Н.Ю., Чихиржина
Г.И., Tuohimaaa
P. Кальцитриол индуцирует транскрипцию гена
трансформирующего фактора роста плаценты- в клетках
предстательной железы по андроген-независимому
механизму. (2006) Молекулярная
биология. 40(1):
84-89.
Ovchinnikova TV, Balandin SV, Aleshina GM, Tagaev AA, Leonova YF, Krasnodembsky ED, Men'shenin
AV, Kokryakov VN. Aurelin, a novel
antimicrobial peptide from jellyfish Aurelia aurita with structural features of
defensins and channel-blocking toxins. // Biochem Biophys Res Commun.
2006. Vol. 348,
No. 2. P. 514-523.
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Транскрипционная машина РНК-полимеразы III: строение и регуляция транскрипции (обзор). // Молекулярная
биология. 2005. Т. 39. № 2. С. 179–192.
Никитина Т.В., Тищенко Л.И. Компьютерный поиск потенциальных участков посттрансляционных модификаций субъединиц РНК-полимеразы III
человека. // Молекулярная биология. 2005. Т. 39. № 3. С. 437–444.
Nazarova N., Golovko O, Bläuer
M, Tuohimaa P. Calcitriol inhibits growth response to Platelet-Derived Growth
Factor-BB in human prostate cells. // J Steroid Biochem Mol Biol.
2005; 94(1-3):189-196.
Lou YR, Nazarova N., Talonpoika R, Tuohimaa P. 5alpha-dihydrotestosterone inhibits 1alpha,25-dihydroxyvitamin D3-induced expression of CYP24 in human prostate cancer cells. // Prostate. 2005 May 15;63(3):222-230.
Щеголев Б.Ф., Рогачевский И.В., Мак Ки М.Л., Кокряков В.Н., Плахова В.Б., Крылов Б.В. Квантовохимическое иследование
пространственного и электронного строения молекул эндогенных пептидов NP-4 и
NP-5. // Журнал общей химии. 2005. Т.75, вып.3. с.509-515.
Voynova, NE, Rios, SE,
Miziorko, HM Staphylococcus aureus mevalonate kinase: isolation and
characterization of an enzyme of the isoprenoid biosynthetic pathway. // Journal
of Bacteriology, 2004. V.186, #1, PP 61-67.
Ovchinnikova T.V.,
Aleshina G.M., Balandin S.V., Krasnodembskaya A.D., Markelov M.L., Frolova
E.I., Leonova Yu.F., Tagaev A.A., Krasnodembsky E.G., Kokryakov V.N. Purification
and primary structure of two isoforms of arenicin, a novel antimicrobial
peptide from marine polychaeta Arenicola marina. // FEBS Lett.
2004. Vol.577. P.209-214.
Nikitina T. V., Nazarova
N.Y.,
Aksenov N.D., Tishchenko L. I., Tuohimaa P., Sedova V. M.. Small stable RNA
level depends on the physiological state of the cell. // Цитология. 2004. Т. 46 № 5. С. 437-441.
Nazarova N., Qiao S, Golovko
O, Lou YR, Tuohimaa P. Calcitriol-induced prostate-derived factor: autocrine
control of prostate cancer cell growth. Int J Cancer. 2004 Dec 20;112(6):951-958.
Востров А.А., Ещенко
Н.Д., Тахени М.Дж., Квичке
В.В. Белок CTCF — транскрипционный фактор гена предшественника ?-амилоида: выделение и очистка рекомбинантной
формы // Нейрохимия. 2004. Т. 21, № 3. С. 225—232.
Korneva E.A., Kokryakov
V.N. Defensins: antimicrobial peptides with a broad spectrum of biological
activity. // Neuroimmune Biology. 2003. Vol. 3. P.451-462.
Никитина Т. В., Назарова Н. Ю., Тищенко
Л. И., Туохимаа
П., Седова В. М. Использование метода RT-PCR в реальном
времени для изучения уровня экспрессии малых стабильных РНК в клетках эпидермоидной карциномы человека А431. // Цитология.
2003. Т. 45. №4. С.392-402.
Pulina M.O., Zakharova E.T., Sokolov A.V., Shavlovski M.M., Bass M.G., Solovyov K.V. Kokryakov V.N., Vasilyev
V.B. Studies of the ceruloplasmin-lactoferrin complex. // Biochemistry
and Cell Biology. 2002. Vol. 80. No.1 P.35-39.
Plakhova V.B.,
Shchegolev B.F., Rogachevskii I.V., Nozdrachev A.D., Krylov B.V., Podzorova
S.A., Kokryakov V.N. A possible molecular mechanism for interaction of
defensin with the sensory neuron membrane // Neuroscience and Behavioral
Physiology. 2002. Vol.32. No.4. P.409-415.
Leonova L.E.,
Kokryakov V.N, Aleshina G.M., Hong T., Nguyen T., Zhao Ch., Waring A.J., Lehrer R.I.
Circular minidefensins and posttranslational generation of molecular diversity.
// Journal of Leukocyte Biology. 2001, Vol. 70, p.461-464.
Karasev V.A., Stefanov
V.E. Topological nature of the genetic code. // J.Theor.Biol.,
2001, V. 209, n 3, p. 303-317.
Karasev V.A.,
Demchenko E.P., Stefanov V.E. The topological coding of polymers and
protein structure prediction.// Mathematical Chemistry, 2000,
V.6, p. 295-345.
Karasev V.A.,
Fundamensky V.S., Bannova I.I., Franke V.D., Stefanov V.E.
Crystallization of the Isobuthylphosphocholine×Cholesterol×Isobutanol (1×3×3) Complex and Its Investigation by X-ray Analysis: Modeling of the
membrane structure // Biochim. Biophys. Acta. 2000. V.1466. P.23-38.
Чихиржина Г. И., Романовская Е. В., Назарова Н. Ю., Федорова С. Взаимодействие регуляторной
области гена триптофандиоксигеназы с
транскрипционными факторами семейства NF1. (1999) Цитология, 41: 939-945
Stefanov V.E., Tulub A.A.,
Kutin A.A. The effect of the chain length of polynucleotides on their binding
with platinum complexes// Int. J. of Biological Macromolecules,
1999, V.26, p.161-166.